Żółtej gorączce można zapobiec przez szczepienie, które zapewnia długotrwałą odporność (ponad 10 lat), skuteczne u 90-95% biorców.
Szczepionka, obecnie zatwierdzona przez Światową Organizację Zdrowia, składa się z żywego i atenuowanego wirusa żółtej gorączki 17D, hodowanego na embrionie kurczaka. Szczepionkę podaje się w pojedynczej dawce wstrzykiwanej w ramię, którą należy odnawiać co 10 lat. Przeciwciała ochronne pojawiają się 7-10 dni po zaszczepieniu.
Szczepienia, oprócz tego, że są obowiązkowe w niektórych miejscach, są jednak zalecane dla podróżnych podróżujących do endemicznych obszarów Afryki i Ameryki. Z drugiej strony, szczepionka przeciw żółtej febrze jest przeciwwskazana u dzieci przed 4 miesiącem życia oraz u kobiet w ciąży; Zaleca się szczególną ostrożność u osób uczulonych na białka kurczaka lub jaja, u osób z obniżoną odpornością z powodu chorób lub terapii, u dzieci w wieku poniżej 9 miesięcy iu osób w podeszłym wieku.
