Infekcje pokarmowe są spowodowane spożywaniem pokarmów zanieczyszczonych różnymi patogenami .
Jeśli choroba jest spowodowana bezpośrednio obecnością często dużej liczby drobnoustrojów w pożywieniu, nazywa się to zatruciem pokarmowym . Kiedy jednak jest to spowodowane toksynami wytwarzanymi przez zarazki w żywności, mówimy o intoksykacji . W zależności od przypadku manifestują się one nudnościami, wymiotami, biegunką, gorączką, reakcjami skórnymi, utratą masy ciała i odwodnieniem.
Wirusy jelitowe i Salmonella są najczęstszymi czynnikami toksykologicznymi; Najczęstszymi zatruciami są jednak toksyny bakterii Staphylococcus aureus i Bacillus cereus . Clostridium botulinum zasługuje na osobną dyskusję, odpowiedzialną za najpoważniejsze (ale na szczęście nie częste) zatrucie pokarmowe: zatrucie jadem kiełbasianym . Żywność i napoje mogą być również nośnikami do przenoszenia wielu chorób zakaźnych, które mogą czasami powodować poważne epidemie, takie jak cholera, wirusowe zapalenie wątroby typu A, dur brzuszny i paratyfus.