Żółta gorączka jest chorobą występującą w stanie endemicznym w Ameryce i Afryce, pomiędzy 15. równoleżnikiem północnym a 10. równoleżnikiem południowym.
Częstość występowania jest wyższa na obszarach sawanny w środkowej i zachodniej Afryce, w późnej porze deszczowej i początkowej porze suchej, z sporadycznymi epidemiami na obszarach miejskich i na wsiach. Światowa Organizacja Zdrowia szacuje, że na kontynencie afrykańskim rocznie dochodzi do 200 000 przypadków.
Z drugiej strony, w Ameryce Środkowej i Południowej niektóre regiony równikowe i tropikalne są endemiczne: epizody są sporadyczne (wynoszą 100-200 przypadków rocznie) i występują szczególnie w sezonie, w którym odnotowuje się szczyt opadów; jest bardzo mało przypadków zakażonych turystów.
