Wirus Marburg bierze swoją nazwę od niemieckiego miasta o tej samej nazwie, gdzie po raz pierwszy pojawił się w 1967 r., Kiedy spowodował trzy jednoczesne wybuchy w Niemczech (miasta Marburg i Frankfurt) oraz w byłej Jugosławii (Belgrad). W obu krajach wirus Marburg został prawdopodobnie wprowadzony z importem zielonych małp z Ugandy ( Cercopithecus aethiops, znany również jako szaro-zielony Cercopiteco).
Pierwsze przypadki odnotowano wśród personelu laboratorium w bliskim kontakcie z tymi naczelnymi. Przypadki wtórne dotyczyły personelu medycznego w szpitalach narażonych na zakażony materiał biologiczny.
Następnie sporadyczne epizody lub ogniska odnotowano w Republice Południowej Afryki, Kenii, Demokratycznej Republice Konga i Angoli, w sumie około 600 przypadków i 480 zgonów.
